FLAC和APE的区别有：
1、自我纠错能力不同
无损格式压缩的不好也会导致编码损坏，即爆音现象，而在处理这种问题时，FLAC的会以静音方式代替有损部分，而APE的处理则与常见的有损压缩格式处理的方式相同，以爆音方式代替有损部分。这一点FLAC设计的更人性化。
2、解码的速度不同
由于编码方式的不同，将影响两种无损压缩格式的解码速度，通常FLAC的解码速度比APE快30%，这是因为，FLAC只需执行整数运算，而无需执行占用系统更高频率和更大数据处理量的浮点运算。基于这一点，一般硬件均可完美实现实时解码。
3、资源获取方面不同
无论FLAC还是APE，在资源获取上，两者都能通过网络搜索轻松获得。单从技术角度讲，FLAC要明显比APE优秀，原因在于，FLAC是第一个开源的且被世界公认的无损压缩格式，有来自世界各地的顶尖级开发高手对FLAC进行免费的开发与技术完善，同时，FLAC有广泛的硬件平台的支持，几乎所有采用便携式设计的高端解码芯片都能够支持FLAC格式的音乐。
FLAC第三个优势在于： 优秀的编码使得硬件在解码时只需采用简单的整数运算即可，这将大大降低所占用的硬件资源。不过两种公开的技术具有极强的互补性，任何一方都不可能全面超越另一方。
