两款都是可以达到1:1物像比的微距镜头， 即在最近对焦距离时可实现成像与实物相同大小，对于拍珠宝这种可以靠近的物体来说，两款都是可以的，也不需要1:1放大，因为感光CMOS都没5CM这么大。
两者的差别有以下几点：
1：景深不同，60mm景深大，100mm景深浅，也就是说在相同光圈值下，后者在深度方向的对焦清晰范围更小，即虚化效果更好。
2：最近对焦距离不同，即要达到1:1时，前者要靠被摄体更近，最近对焦距离不是物体到镜头的距离，而是物体到成像平面（即CMOS，通常在机身靠近背部）的距离。距离近的话，容易挡住光线，在拍摄别的小动物时也容易惊扰。
3：卡口不同，前者是EF-S，即APSC专用，不能用于5D和1Ds系列的全幅机即胶片机上，将来也不能用于后续的全幅机上。后者是EF卡口，可用于所有数码机和胶片机上（兼容全幅和APS画幅），将来上了全幅也能继续用。
4：成像质量不同，100mm是著名的“百微”，成像锐度等质量都比60mm的好，所用的镜片也比60mm的好。
5：价格不同，100mm的当然要比60mm的贵。差价大约600多。60mm水货价2800。100mm水货价约3450。
