根据相关法律规定，出现医疗纠纷以后，可以通过双方共同协商处理(私了)、卫生行政部门行政处理、民事诉讼司法程序处理。其中，调解原则贯彻始终，司法鉴定结论或医疗事故技术鉴定结论是各种处理途径的科学依据之一。
有多条合法途径可解决医疗纠纷，如医患双方自行协商，在卫生行政主管部门主持下调解，依法向人民法院提起诉讼等;有些地方还出现了民间调解组织，居中调解医疗纠纷。
一般情况下，医患双方可自行协商，如未能通过协商等途径解决，这时患者及家属可以就双方的纠纷向人民法院提起诉讼。因医疗损害赔偿向人民法院提起诉讼的案由，主要有医疗服务合同纠纷和医疗损害赔偿纠纷两类。其中，医疗损害赔偿纠纷又可分为一般医疗损害赔偿纠纷和医疗事故损害赔偿纠纷，不同的案由适用法律不同，计算赔偿数额的依据亦不同。
