根据《财政部国家税务总局关于收费公路通行费增值税抵扣有关问题的通知》财税〔2016〕86号规定：一、增值税一般纳税人支付的道路、桥、闸通行费，暂凭取得的通行费发票（不含财政票据，下同）上注明的收费金额按照下列公式计算可抵扣的进项税额：高速公路通行费可抵扣进项税额=高速公路通行费发票上注明的金额÷（1+3%）×3%一级公路、二级公路、桥、闸通行费可抵扣进项税额=一级公路、二级公路、桥、闸通行费发票上注明的金额÷（1+5%）×5%。
通行费发票分为财政部监制和国税监制，一定要区分，只有国税监制的都可以抵扣。
