开办县级民营医院程序如下：
一)申请设置人必须具有中华人民共和国执业医师资格；
(二)申请设置人具有当地户籍；
(三)取得《医师执业证书》或医师职称后，在二级以上医疗机构从事5年以上同一专业的临床工作；
(四)注册资金5万元以上；
(五)符合开设医院的基本条件。
在农村乡镇申请设置医院的条件是：
(一)申请设置人必须具有执业医师资格；
(二)申请设置人具有本市户籍；
(三)取得《医师执业证书》或医师职称后，在一级以上医疗机构从事3年以上同一专业临床工作；
(四)注册资金5万元以上；
(五)符合开设医院的基本条件。
八、有下列情形之一的，不得申请设置私营个体医疗机构：
(一)不能独立承担民事责任的单位；
(二)正在服刑或者不具备完全民事行为能力的人员；
(三)发生二级以上医疗事故未满5年的医务人员；
(四)被吊销执业证书的医务人员；
(五)被吊销《医疗机构执业许可证》的医疗机构法定代表人；
(六)因道德败坏，医德医风恶劣受记过以上行政处分未满5年的人员；
(七)被开除公职或擅自离职的人员；
(八)医疗机构中在职、因病退职或停薪留职的医务人员；
(九)患甲、乙类传染病未愈或者因其他健康原因不宜执业行医的人员。
九、公开办事程序，提供办事指南。指导其选择合适医疗用房，聘用合格的医务人员。各级卫生行政部门在收到个体私营医疗机构完备申报材料后，依法在30日内作出同意与否的书面答复，同意设置者应发给《设置医疗机构批准书》(有效期1年)。申请执业登记的，还必须达到卫生部规定的医疗机构基本标准，包括执业人员资质、房屋面积、相应设备、消毒隔离和注册资金等标准。在提交规定材料后，经验收合格，在45天内给予答复。
十、维护私营个体医疗机构及其从业人员合法权益，在聘人用人、职称评定、参加学术组织和活动、社会保障、经营权等权益上应受到尊重和维护。
十一、依法监督、加强管理。
私营个体医疗机构应按照《执业医师法》、《医疗机构管理条例》等法律法规依法执业，规范医疗执业行为。各级卫生行政部门对私营个体医疗机构既要积极鼓励引导，又要依法管理，加强监督检查，规范执业行为，保障人民群众健康，促进私营个体医疗机构健康发展。
法律依据：
（1）《医疗机构管理条例》（国务院令第149号）
（2）《医疗机构管理条例实施细则》（1994年8月29日卫生部令第35号）
（3）中外合资、合作医疗机构管理暂行办法（2000年5月15日卫生部、对外贸易经济合作部令第11号）
（4）《医疗美容服务管理办法》（2002年1月22日卫生部第19号令）
（5）关于加强医疗单位开展戒毒治疗管理工作的通知（卫药发〔1993〕第6号）
（6）关于下发《医疗机构诊疗科目名录》的通知（卫医发〔1994〕第27号）
（7）关于下发《医疗机构基本标准（试行）》的通知（卫医发〔1994〕第30号）
（8）关于发布《眼科医院基本标准（试行）》、《妇产医院基本标准（试行）》、《耳鼻喉医院基本标准（试行）》的通知（卫医发〔1996〕第24号）
（9）关于加强戒毒医疗机构管理工作的通知（卫药发〔1996〕第35号）
（10）卫生部关于戒毒医疗机构须报禁毒机构审批的通知（卫医发〔1999〕第386号）
（11）卫生部关于印发《医疗美容机构、医疗美容科（室）基本标准（试行）》的通知（卫医发〔2002〕103号）
（12）关于印发《云南省医疗机构分类管理暂行办法》的通知（云卫〔2001〕175号）
2．条款内容
（1）《医疗机构管理条例》[国务院149号令(1994年2月26日)]
第九条：“单位或者个人设置医疗机构，必须经县级以上地方人民zhengfu卫生行政部门审查批准，并取得设置医疗机构批准书，方可向有关部门办理其他手续。
第十五条：“医疗机构执业，必须进行登记，领取《医疗机构执业许可证》
第十七条：“医疗机构的执业登记，由批准其设置的人民zhengfu卫生行政部门办理。
