1集小智和皮卡丘前往阿罗拉地区旅行，自然资源丰富的阿罗拉地区也极具魅力。在那里，小智与新的精灵宝可梦们相遇，并且了解到了精灵宝可梦学校。兴奋不已的小智在夜晚被一个不可思议的声音所引导...
2集因为被阿罗拉地区所吸引，小智和皮卡丘选择留宿在库库伊博士家，并且进入精灵宝可梦学校学习。有一天，小智的同班同学为小智举办了一场秘密欢迎会。在热闹的欢迎会上，阿罗拉地区的守护神卡璞?鸣鸣来访了...？
3集小智从库库伊博士那儿得到了一只被称为“洛托姆图鉴”的会说话的宝可梦图鉴，拿到图鉴后，小智带着皮卡丘和洛托姆图鉴与他的同学们一起兴高采烈地前往森林捕捉野生宝可梦。另一方面，火箭队三人组收到坂木的指令，也来到了阿罗拉。
