南通市城市轨道交通近期建设规划（2014-2020年）已由国家发展和改革委员会以发改基础【2014】1854号审批，项目业主为南通城市轨道交通有限公司，建设资金自筹，招标人为南通城市轨道交通有限公司，项目已具备招标条件。
在交通组织方案设计招标公告中，明确了招标范围：本次交通组织工作范围为1号线涉及28个站点，1处停车场，1处车辆段，2处主变电站；2号线涉及18个站点，1处车辆段。要求中标单位进行施工交通组织方案设计和施工期区域交通影响评估及改善策略研究，出具相应设计方案，各分期施工落实方案。
1号线路北起通州区平潮镇，经通州区、港闸区、崇川区至终点南通经济技术开发区振兴路，一期工程全长约39.46km、28座车站。2号线路北起幸福镇，经港闸区、崇川区、通州区至先锋镇，一期工程全长约20.4km、18座车站。
1号线一期工程共划分4个标段，范围分别是：01标为设计起点至07站（不含）（6站6区间2出入线）；02标为07站至14站（不含）（7站7区间），1车辆段；03标为14站至21站（8站7区间），主变电站，1停车场；04标为21站（不含）至1号线一期设计终点（7站7区间）。
南通地铁一号线一期
1号线一期起于南通西站，沿长泰路东行，穿越地块后，经永和路至城港路后折向东至外环西路，之后线路向东转入人民路，线路沿人民路向东至工农路，沿工农路南行至崇川路后线路折向东，沿崇川路经南通大学至通盛大道，沿通盛大道向南至能达商务区，设振兴路站为一期终点站。
1号线一期沪通铁路至G204、城北大道区段为高架线，其余均为地下线。
共28个站点：平潮站、南通西站站、集成村站、惠民路站、永福路站、永兴大道站、深南路站、城港路站、江海大道站、汽车站站、孩儿巷路站、环西文化广场站、环城东路站、中级法院站、青年路站、虹桥路站、洪江路站、世纪大道站、中央商务区站、南通大学站、盘香路站、太平路站、通沪大道站、居美路站、居康路站、宏兴路站、能达商务区站、振兴路站（以上站点粗略整理，一切以实际站点为准）
南通地铁2号线一期
线路全长20.4公里，共设16座车站，其中地下线19.1公里，地面及高架线路1.3公里；1座车辆段，1座主变电所(与1、3号线合建)及相配套的车辆和机电设备。控制中心与1、3、4号线合建。轨道2号线一期起于幸福镇站，向南连接南通火车站，出站后沿北大街南行，过江海大道线路向西折向濠西路，沿濠西路向南接入环西文化广场站，线路沿濠河继续南行至体育公园并设站，线路折向东沿青年路至先锋镇，设先锋镇站为一期工程终点。2号线一期南通东站站－先锋镇区段采用高架形式，其余均为地下线。工程在港闸区幸福镇通刘公路以东，城北大道以北，沪陕高速以南设定修段—幸福车辆段。
