首先明确一点，建在山上的一般是光学观测站，太阳观测站一般建在水边，射电站一般选择在平原上，后两者的具体原因我就不说了，主要说为什么把光学观测站建在山上。
其实原因很简单，就是尽量躲开地球大气中的水汽。水汽会严重干扰望远镜的正常工作，让本来能看清的东西变得模糊不清。我们虽然可以对望远镜周围和圆顶内部进行除湿，但却没法管外部大气中的水分情况，所以，只能尽量避开。显然，将望远镜建在高一点的地方，望远镜上方的大气就变少了，水汽也更少，这跟我们在高原上感觉天更近了是一个道理。而且，大气在垂直方向不是均匀分布的，而是呈指数形式，越靠近地面水汽的密度越大，所以只要“稍微”将望远镜架的高一点，水汽就能减少很多很多。我不记得具体数值，似乎在海拔2k还是4k的地方，就可以避开大约90%的水汽。而且将望远镜架高，还可以有效避免云层的影响（有云显然无法观测）。世界比较著名的优良站址，比如夏威夷的莫纳克亚以及智力，望远镜的位置普遍在4000米左右。当然为了避免高原反应，观测人员生活休息的地方建在山腰大约2000米的地方，需要观测时开车上去，而且在望远镜工作时要随身带一小瓶氧气。在那边的照片有时会看到云层在望远镜下方形成云海的样子，蔚为壮观。
