南京大学、东南大学和南京理工大学考研是什么难度，这个问题不难回答，但是要区别的看。首先，不管是文科还是理科，南京理工大学和南京大学、东南大学都不是一个层次的，没有可比性。
再看南京大学和东南大学，一个是前中央大学的文理学院，一个是前中央大学的工学院，都具有很强的实力，都是“双一流”高校和原985高校，综合实力和文理科上南京大学更强一些，但是工学和建筑学东南大学的的实力更强。南京大学的强势学科主要是一些基础学科，比如说物理学、化学、地质学、天文学等，都是老中央大学的底子，当然程千帆的中国古典文学和王瑶的中国现当代文学还是能够平分秋色的，在哲学和历史学方面都有很强的实力。
东南大学是中国四大工学院：大连工学院、南京工学院、华中工学院、华南工学院之一，也是中国建筑老八校：清华大学、东南大学、同济大学、天津大学、华南理工大学、重庆大学、哈尔滨工业大学、西安电子科技大学等之一，不仅具有很强的工学实力，而且在建筑学领域也有不凡的表现。因此相较于同济大学，实际上学科布局更加多元，更具有发展后劲。
如果考研的话，文理科推荐南京大学，工科和建筑学推荐东南大学。至于南京理工大学，其前身为哈军工，有军工的背景，是立志于进军队或者从事相关职业的同学报考。
