现在P2P的资金托管方式有两种，一种是托管在第三方支付平台，另一种是银行存管模式。
首先说明第三方支付的托管；那么必须要了解第三方支付很重要的一种模式——虚拟账户模式。不同于第三方支付的网关支付模式，在虚拟账户模式中，收付款方均需要在第三方支付平台注册开立第三方支付账户，并关联到各自的银行账户。这里面就有了两套账户体系，在资金走向上，是由付款方的银行账户转至第三方支付公司在银行开立的备用金账户，最后再由第三方支付公司的银行账户转至收款方的银行账户，整个过程中资金经过了第三方支付公司的银行账户。
目前，这种模式已经明确被监管部门否定了。2016年8月四部委联合下发的《网络借贷信息中介机构业务活动管理暂行办法》第二十八条网络借贷信息中介机构应当实行自身资金与出借人和借款人资金的隔离管理，并选择符合条件的银行业金融机构作为出借人与借款人的资金存管机构。因此，第三方支付公司的P2P托管业务已经明确了不可以。
此前第三方支付公司的P2P存管模式主要是投资人和借款人分别在第三方支付平台的系统中开设账户，而且在交易发生时，资金是从投资人的账户直接转入借款人的账户，中间不会通过平台这一层，做到用户的账户金额显示多少便能实时的提现多少、使用多少。但是这种模式被托管的资金，实际仍放在支付公司的支付备付金账户中，也没有做到真正的资金专户专用。
根据最新的监管文件来看，《关于做好P2P网络借贷风险专项整治整改验收工作的通知》（57号文），P2P平台必须要有银行存管方可运行，并且给出了严格的要求，明确了做存管业务的银行，必须通过中国互联网金融协会、银行、及技术服务商三方联合团队的测评。通过测评的银行则会在金融中国互联网金融协会的存管银行白名单，没有通过或者不申请测评，则不能开展银行存管业务。如果P2P平台所对接上线的存管银行，如果没有进入白名单，则平台也无法再明年6月份通过备案。
目前，银行与互金平台进行银行存管合作有三种模式，分别是银行直连、直接存管和联合存管。直接存管和银行直连才是更合规的存管模式。联合存管之所以被列为国家监管红线之内，主要原因在于用户资金不是直接到达银行，而是需要先经过第三方支付才可到达银行，同时用户资金及流向不由银行监管。
