1、工作原理不同
电喷柴油机采用电子控制燃油喷射及排放的柴油机即为电喷柴油机。电喷柴油喷射系统由传感器、ECU(计算机)和执行机构三部分组成。
柴油发动机是燃烧柴油来获取能量释放的发动机。
2、特点不同
电喷柴油机的任务是对喷油系统进行电子控制，实现对喷油量以及喷油定时随运行工况的实时控制。
柴油发动机的优点是扭矩大、经济性能好。柴油发动机的工作过程与汽油发动机有许多相同的地方，每个工作循环也经历进气、压缩、做功、排气四个冲程。
3、功能不同
电喷柴油机采用转速、油门踏板位置、喷油时刻、进气温度、进气压力、燃油温度、冷却水温度等传感器，将实时检测的参数同时输入计算机(ECU)，与已储存的设定参数值或参数图谱(MAP图)进行比较，经过处理计算按照最佳值或计算后的目标值把指令送到执行器。
柴油机的热效率和经济性较好，柴油机采用压缩空气的办法来提高空气温度，使空气温度超过柴油的自燃点，这时再喷入柴油、柴油喷雾和空气混合的同时自己点火燃烧。
参考资料来源：百度百科-柴油发动机
参考资料来源：百度百科-电喷柴油机
