镇江市住房公积金管理中心的主要职责有：
（一）贯彻执行国家关于住房公积金管理的法规和政策，执行市住房公积金管理委员会关于住房公积金管理的决策部署；编制、执行住房公积金归集、使用计划，编制住房公积金归集、使用计划执行情况的报告；负责住房公积金的保值和归还。
（二）负责拟定全市住房公积金具体管理办法，经市住房公积金管理委员会审批通过后组织实施；负责制定全市住房公积金职工购房贷款管理办法并组织实施；参与制定住房制度改革有关政策并参与组织实施。
（三）负责住房公积金缴交管理，按照《条例》规定，依法检查、监督单位、职工住房公积金缴存情况，查处违规、违法行为，依法行使行政处罚权；核批住房公积金降低缴存比例与缓交；审批住房公积金提取；负责住房公积金资金运用，审批、发放、回收住房公积金购房贷款，确保资金安全；负责住房公积金财务管理与核算，记载职工住房公积金的缴存、提取、使用等情况，为职工发放住房公积金有效凭证；
（四）负责对承办住房公积金金融业务的金融机构相关业务的管理、指导与监督；负责指导、监督辖市（区）住房公积金分中心（管理部）的住房公积金及相关业务；经商辖市（区）意见后，负责分中心（管理部）行政领导的任免；负责对有关单位参与住房公积金职工购房贷款相关业务的指导、管理与监督。
（五）负责政府委托的其他住房基金的管理与核算；制定其他住房基金相关规定与办法并组织实施；承办市住房公积金管理委员会决定的其他事项。
镇江市住房公积金管理中心内设机构
（一）综合处（挂“审计监督处”牌子）
负责中心文秘、行政、综合调研等项工作，处理日常行政事务，协调内外部关系；负责有关重要会议的组织；起草有关重要报告和文件；负责中心信息、宣传和新闻发布工作；负责文电、机要、档案、保密、信访、后勤、资产管理工作；督办、检查各项决议和会议精神的落实，负责人大、政协提案的办理工作；负责中心内部制度建设，组织实施内部考核，组织行政督察，定期开展对中心有关处室及分中心（管理部）行政执法情况的检查和执行财经纪律的内部审计；负责中心党风廉政建设和精神文明建设工作；负责对分中心（管理部）对口工作进行指导、管理。
（二）归集管理处
负责住房公积金归集计划的编制和组织落实工作，依法检查监督单位、职工住房公积金缴存情况，查处违规、违法行为；负责住房公积金提取审批工作；发放职工住房公积金有效凭证；负责住房公积金基数调整和缓交审批工作；办理住房公积金开户登记；负责对承办住房公积金缴交业务的金融机构相关业务的管理、指导与监督；负责对分中心（管理部）对口业务进行指导、管理。
（三）贷款管理处（挂“资产保全处”牌子）
负责住房公积金使用计划的编制；拟定住房公积金职工购房贷款办法并组织实施；审批、发放、回收住房公积金职工购房贷款；参与拟订住房公积金贷款风险防范管理办法，确保贷款回收，实现资产保全；负责住房公积金业务的行政诉讼；办理呆账核销手续；负责贷款档案的管理；协助归集管理处做好住房公积金归集工作；负责对承办住房公积金购房贷款业务的金融机构相关业务的管理、指导与监督；负责对分中心（管理部）对口业务进行指导、管理。
（四）计划财务处
负责住房公积金资金计划和业务经费预决算的编制；负责住房公积金及其他住房基金财务管理与会计核算；负责住房公积金净收益的分配和廉租房补充资金的筹集、使用和管理，拟定具体办法并组织实施；负责机关财务核算；负责国债购买和资金安排；负责全市住房公积金报表汇总与分析；负责住房公积金及其他住房基金的年度结息；负责对分中心（管理部）对口业务进行指导、管理。
（五）信息技术处
负责计算机硬件、软件、网络系统管理、维护与升级；负责建立办公自动化系统；负责计算机网站的建立和自动查询系统的管理；定期做好有关业务数据备份；负责计算机应用人员的培训和技术指导；负责对承办住房公积金业务的金融机构相关工作的指导、管理、监督；及时办理与金融业务承办银行间的票据交接和数据录入；负责对分中心（管理部）对口业务进行指导、管理。
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