是超神罗天征啊
佩恩带领六道突破木叶村设的结界然后大开杀戒，许多忍者死于混战，最后连卡卡西也不敌修罗道，耗尽查克拉而死。最后天道使出神罗天征将木叶村彻底毁灭，这时候鸣人也出现了，最后佩恩六道一个个倒下，最后天道也被鸣人用螺旋丸击毙。佩恩六道就此全部死亡。
再次寻找佐助的踪影失败后，鸣人回到木叶，却惊闻自来也被佩恩杀害的噩耗。为此曾一度悲伤的他，因为伊鲁卡和鹿丸的鼓励，而再度重新振作起来，并协助解开自来也临终前留下的暗号；可惜的是毫无头绪。
为了替自来也报仇，他决定接受深作大人的提议，前往自来也曾修行的妙木山，作艰苦的“仙术”训练。经过一番修行，鸣人总算是基本掌握了自然力量，深作将自来也的遗作——《坚毅忍传》交给鸣人。
鸣人基本掌握了深作所授的“蛙组手”和仙术。深作告诫鸣人有关仙人模式的缺点，就是只能维持5分钟左右；而且每一次使用前，需经一段时间、在静止的状态下吸取足够的自然力量。这样就很容易成为敌人的靶子，因此使用时必须有其他伙伴在旁边提供增援。但深作认为最有效的方法，就是与鸣人融为一体，分担“动”和“静”两边的工作，不过，由于受到九尾的阻挠，融合并未成功（事后九尾承认是由于对鸣人和蛤蟆混在一起感到不满而故意阻挠）。另一边，木叶遭到佩恩的袭击，佩恩由于得知鸣人在妙木山修行，继续攻击毫无意义，便用神罗天征摧毁了整个木叶，好在纲手及其蛞蝓保护了大家。鸣人等被志麻仙人通灵回满目疮痍的木叶村，佩恩六道齐聚准备捕捉九尾，鸣人得知卡卡西死讯，愤怒之下单挑六道。鸣人的仙人模式加上新术仙法·风遁·螺旋手里剑，且在两位仙人的帮助下本是压倒性优势。但由于佩恩实力强大，费劲艰辛才打败五个佩恩，剩下天道尚存。深作仙人被天道杀死，鸣人的仙人模式解除，被天道擒获。天道试图摧毁鸣人的意志，一番谈话下，鸣人不置可否。雏田为救鸣人
成为英雄
而出被天道打伤，鸣人误以雏田死亡，愤怒之下爆发九尾查克拉，现出八条尾巴，天道用地爆天星困住鸣人。
鸣人在九尾怂恿下准备揭开封印之时，三代目封印的查克拉现身阻止，鸣人才得知自己的身世，四代与鸣人交谈后重新封印九尾，并消失。鸣人脱离地爆天星的束缚，打败天道，并用逆向探查找到佩恩本体——长门。
与鸣人的交谈中，长门被鸣人感化。放弃原定计划，决定将梦想托付给鸣人。期盼鸣人能够完成几代人的使命，之后因施展外道轮回天生之术耗尽生命而死。鸣人送走小南，回到木叶。
