青岛已经有新农合保险了，在公司可以缴纳社保吗

对的，两种同时有的，到时只能使用一种。
“农民自愿参加新型农村合作医疗”，是国家新农合政策的根本政策；“必须以家庭为单位整户参加，按照本办法规定及时缴纳新型农村合作医疗资金”，指的是不能以个人为单位参加新农合，应该是以“户”为单位，但各地由又有自己的具体政策。至于你们那里是不是真的“少一个人就不能享受新农合”，感觉像你这种情况应该比较特殊，应该允许不参加新农合。你最好去问下你们当地的管理部门，把你的详细情况说下。
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