1、分级不同
二本A类好于二本B类院校，虽然，两者在学历上都是二本本科学历，但是，本科教育院校是分为“重点本科高校”与“普通本科高校”。
2、侧重不同
“重点本科高校”与“普通本科高校”只是侧重不同，无本质差别，前者非常注重理论研究，后者更注重理论实践应用。
3、办学制度不同
A类院校为一般公办本科院校；B类院校为本科院校分校或近几年国家批准从专科升为本科的院校，一般是民办三本大学或者独立学院。
4、公私区别
本科A类及以上的是公立大学，而相对来说,本科B类就是私立大学了。
扩展资料：
普通二本大学只是个模糊的概念，指的是录取批次放在第二批的大学，每个省的情况都不大一样。比如安徽理工大学，在外省是放在普通二本批次录取的，但是在安徽本省和几个指定省份就是一本（包括重点一本、普通一本）录取，
又如西南财经大学天府学院是一所财经独立学院，在四川，山东，福建，上海等省市招收本科第二批次考生，其它省份招收三批考生，所以西南财经大学天府学院也是二本。此类二本学院还有“长春建筑学院”。
但是总体上来说，一本大学（包括重点一本、普通一本）大都是部委直属大学或者“211工程”大学，而普通二本大学大多为省属大学或者非“211工程”大学，二者在师资、硬件等方面还是有一定差距的。这也是为什么大家都追捧一本大学的主要原因。
但是相对来说，考上一本大学的学生毕竟是少数，更多的同学读的是普通二本、普通三本大学。纵观全国的高考形势，重点大学停止扩招而高考报名人数不断攀升，预示着普通二本、普通三本大学将成为高考战场上的热点。
科高考入取批次的不同，本科123本叫法称呼的不同，本科办学等级（部属、省属、市属）的不同、本科办学体制以及性质（公办、民办）的不同，由办学体制决定的本科学费高低的不同，
本科（123本）各大学毕业证书“本簿和颜色”的相同与不同与本科高校的层次和“学历、文凭”水平的高低无关，所以123本高校是具有相同本科学历和文凭的高校，只是侧重不同，
重点本科高校（985、211高校）重理论研究，普通本科高校（普通123本高校）重理论应用即重点本科重研究，普通本科重应用。
参考资料：百度百科-二本
