蒙古部发迹于斡难之时，本来是没有文字的。1204年，成吉思汗征讨乃蛮之时，乃蛮掌印官回鹘人塔塔统阿虽然遭逮捕，依然守着国家的印信。成吉思汗非常嘉许他忠于自己国家的行为，遂命令他掌管蒙古国的文书印信，并命令他教授太子、诸王畏兀字以书写蒙古语。蒙古人至此时便采畏兀字以书写蒙古语，学界称为回鹘式蒙古文。
自元世祖委托国师八思巴另制八思巴字，每以“畏兀字”呼之，以示区别。但虽然禁令屡下，当时的蒙古人仍然喜欢使用回鹘式蒙古文，八思巴字遂转以转写他族语音。直到明朝建立，元顺帝北返，八思巴新字便罕见有人使用。岭北等处诸蒙人仍以畏兀儿字体为正宗。
十六世纪蒙古信奉佛教，广译遍传佛经，蒙古文字因而普及、定型。因此十六、十七世纪之交，为蒙古之文艺复兴。在这之前书写蒙古语的之部分缺失，皆改进之。此时引入许多藏语、梵语之内典用语，取代以往蒙古人使用的词汇。并且为了便于转译藏、梵语音，另造变体字母。字母之改良以阿里嘎里为大宗。1587年，喀喇沁翻译者阿尤希固什修改旧有的字体，自创了阿里嘎里字体，这个字体可以表达所有的藏、梵语语音，且可以表达诸蒙古语所无之辅音群。此时部分古语遂弃而不用。学界谓此时之书面蒙文为古典蒙文。
清朝时，亦取鉴蒙古字体，创满文以书满语。二者字型相似，故能触类旁通。此后自十七世纪末至十八世纪，古典蒙文得以充分发展。北京、内蒙古之木版印刷业俱盛，谙蒙语之帝王或者是藏族法师都参与编纂辞典、语法书等。
又1648年卫拉特蒙古和硕特部僧侣札雅班第达亦改良传统，分析蒙古文字的标音，造新体字“托忒文字”（todomongγol），但此新字体只通行于天山南北路、伏尔迦河口诸处，东蒙古未有采用。
1686年，喀尔喀僧侣扎那巴扎尔仿造藏文梵字，创造索永布字体，共有字母九十个，左起横书，一样能精确表达藏、梵语，以及蒙古语的语音。索永布字体非常的漂亮，寺院经常以此加以装饰，只可惜此字体写起来比八思巴字还不方便，因此罕用于社会上。同年扎那巴扎尔另造横书方块字，通行于喀尔喀各处之佛寺间。
二十世纪初，曾有蒙古字拉丁化之议，当时却未付诸实行。1946年以降，蒙古国改以西里尔字母拼写喀尔喀口语。而中华人民共和国之内蒙古自治区则仍采传统蒙古字。
