1、 查询发票是否抵扣可以到所在地国税局去查，也可以委托律师到受票企业所在地的国税局去查。
2、有对方公司的税号和网上报税密码，进入网上报税系统—网上认证模块，可以查底到所有已经认证的发票。
3、带上发票原件到对方公司的国税分局大厅让那些工作人员帮你查。
知识拓展：发票抵扣期限（仅供参考）
1、根据《国家税务总局关于进一步明确营改增有关征管问题的公告》（国家税务总局公告2017年第11号）第十条的规定：自2017年7月1日起，增值税一般纳税人取得的2017年7月1日及以后开具的增值税专用发票和机动车销售统一发票，应自开具之日起360日内认证或登录增值税发票选择确认平台进行确认，并在规定的纳税申报期内，向主管国税机关申报抵扣进项税额。
2、增值税一般纳税人取得的2017年7月1日及以后开具的海关进口增值税专用缴款书，应自开具之日起360日内向主管国税机关报送《海关完税凭证抵扣清单》，申请稽核比对。
3、纳税人取得的2017年6月30日前开具的增值税扣税凭证，仍按《国家税务总局关于调整增值税扣税凭证抵扣期限有关问题的通知》。
参考资料：专用发票-百度百科
