其实子婴的身世扑朔迷离，民间也流传着很多种说法，有的猜测他是扶苏的儿子，有的猜测他是秦始皇的儿子，也有的猜测他是秦始皇的弟弟，当然这几种说法真真假假，历史上也没有明确的记载，所以子婴的真实身份其实很难确认。
第一种说法认为子婴是扶苏的儿子。因为在秦始皇的相关记录中就有关于子婴的说法，里面说要立秦二世兄长的儿子公子婴为秦王，这句话的意思很明显，也说明了胡亥的哥哥扶苏的儿子就是子婴，因为当时胡亥是没有子嗣的，所以就将子婴立为皇位的继承人，这种说法还是具有较高可信度的。
还有一种说法认为子婴是秦始皇的弟弟。这是一本书籍中有提及到始皇弟这样的字眼，很多人猜测这个始皇的弟弟应该是子婴，但子婴如果是秦始皇弟弟的话，那他的年纪应该比胡亥大很多，到那个时候赵高扶持子婴起来做皇帝的话就显得有些不合理，因此这个猜测的可能性不是很大。
还有一种猜测就是子婴是胡亥的哥哥，也就是说子婴也是秦始皇的儿子。这个观点同样来自于古书籍中的记载，里面提到过赵高想要拥护秦二世的哥哥为秦王。不过就秦二世残暴的性格而言，他不可能会让自己的兄弟生存下来的，历史记载秦始皇的其他儿子全部都被秦二世杀死了。所以子婴如果是秦二世兄长的话，那他可能早就被杀害，不可能会留下来继承秦二世的位置。
