公司注销国税会查，一般查三年，跟国税有关的，比如增值税的纳税情况，有无偷漏税款等，发现重大问题无期限向前追溯，国税主要是增值税的申报纳税情况 ，看看有无存货及发票使用情况等。
申办公司注销材料
1、公司清算组负责人或公司法定代表人签署的《公司注销登记申请书》
2、清算组成员《备案确认申请书》
3、法院破产裁定、行政机关责令关闭的文件或公司依照《公司法》作出的决议
①有限责任公司提交股东会决议，股份有限公司提交股东大会决议
②有限责任公司由代表三分之二以上表决权的股东签署，股东为自然人的由本人签字，自然人以外的股东加盖公章
③股份有限公司由代表三分之二以上表决权的发起人加盖公章或者股东大会会议主持人及出席会议的董事签字确认
④国有独资有限责任公司提交出资人或出资人授权部门的文件
⑤因违反《公司登记管理条例》有关规定被公司登记机关依法撤销公司设立登记的，提交公司登记机关撤销公司设立登记的决定
4、股东会或者有关机关确认的清算报告
5、刊登注销公告的报纸报样
6、国有独资公司还应当提交国有资产监督管理机构的决定，其中，国务院确定的重要的国有独资公司，还应当提交本级人民政府的批准文件
扩展资料：
公司注销登记
1、社保局
核查是否有未缴清社保费用，然后注销公司社保账号
2、税务局
核查是否有未缴清税款或费用，然后注销公司的国、地税
3、报纸媒体
公司需自行登报公示，宣告公司即将注销
4、工商局
办理公司注销备案，注销营业执照
5、开户行
注销公司开户许可证和银行基本户等其他账户
6、质监局
到质监局注销公司的许可证例如生产许可证
7、公安机关
注销公司印章的法律效应（印章本身可不上交）
参考资料来源：百度百科—公司注销程序
参考资料来源：百度百科—公司注销
