你使用的应该是快门式3D眼镜，这种3D技术原理上是会有闪烁的。快门式3D眼睛是通过加电后改变装有液晶的眼镜片通光性实现3D效果的，其中原理有点复杂，我还是用百度百科资料说明吧。
快门式3D技术设计的3D眼镜主要通过提高画面的快速刷新率（通常要达到120Hz）来实现3D效果，属于主动式3D技术,又叫时分法遮光技术或液晶分时技术.当3D信号输入到显示设备（诸如显示器、投影机等）后，图像便以帧序列的格式实现左右帧交替产生，通过红外发射器，蓝牙等无线方式将这些帧信号传输出去，负责接收的3D眼镜在刷新同步实现左右眼观看对应的图像，并且保持与2D视像相同的帧数，观众的两只眼睛看到快速切换的不同画面，并且在大脑中产生错觉（摄像机拍摄不出来效果），便观看到立体影像。
快门式3D眼镜的每一只镜片均包含有一个液晶层，可以在加载一定电压的情况下变黑（透光率下降）。反之，在没有附加电压的情况下就和普通镜片类似。由于每一帧的3D图像均包含有左、右两幅不同角度拍摄的画面，只有当左画面对应通过左镜片（镜片上没加载固定电压），右画面对应通过右镜片时，观众才能看到3D图像。
因此需要一个同步信号来控制左右镜片的交替和左右画面的交替保持一致。通常，使用红外线来传输这个同步信号。但由于存在着诸如易受日光灯干扰，通讯范围有限等不利因素，也发展出了利用蓝牙，高频无线信号通讯的3D快门式眼镜。在同步信号的控制下，加载在左右两只镜片上的电压交替变化，然后由大脑将两幅图像合成一体来实现3D的视觉效果。
由于本质上来说快门式3D技术的原理是根据人眼对影像频率的刷新时间来实现的，所以通过提高画面的快速刷新率（一般要达到120Hz）左眼和右眼各60Hz的快速刷新图象才会让人对图象不会产生抖动感，并且保持与2D视像相同的帧数。
它主要是靠液晶眼镜来实现的，它的眼镜片实质上是可以分别控制开/关的两片液晶屏，眼睛中的液晶层有黑和白两种状态，平常显示为白色即透明状态，通电之后就会变黑色。通过一种讯号发射装置，让3D眼睛和屏幕之间实现精确同步。显示屏幕上会交替进行左右眼画面的播放，在播放左画面时，左眼镜打开，右眼镜关闭，观众左眼看到需要让左眼看见的画面，右眼什么都看不到。在播放右眼画面是，右眼看右画面，左眼看不到画面，就这样让左右眼分别看到左右各自的画面，从而实现3D立体效果。这个过程交替至少达到120次/每秒，人眼才能欣赏到连贯而不闪烁的3D画面，所以主动式3D显示技术要求屏幕的刷新率至少达到120Hz。
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