请问怎么用SWISS-MODEL预测蛋白质三级结构,页面英文看不懂啊,谢谢

2022-07-29 母婴育儿 240阅读
  1. 进入网站   http://swissmodel.expasy.org/


  2. 选取Modeling中Automated Mode


  3. 在页面上输入你的邮箱(用于接受结果),待分析蛋白质序列(最好是fasta格式)或AC号

    也可以直接输入PDB数据库中的ID号


  4. 我以序列

    >query_prot

    DVNMKLTGRIMDAAKEVDHTCRSSTGVPRDMLHRYAEGQTVDDDDFKCYLKCIMVEFNSLSDDGVFVLEEELENVPPEIKEEGHRVVHSCKHINHDEACETAYQIHQCYKQSDPELYSLVVRAFDATIGD

    为例,按上述操作得到结果(需要等一段时间,甚至会有好几分钟)为

  1. (以上为不完全截图,结果页面链接为http://swissmodel.expasy.org/workspace/index.php?func=workspace_modelling&userid=xucongtys@163.com&token=TOKEN&key=11525fa82165c40ee6884048a459d9c9&prjid=P000008)即得到三级预测结果,从结果页面可得到所用模板的PDB ID号,可将结果用pdf格式保存

  2. (PS:会收到一封邮件,提供结果链接,可保存下来以后直接查看结果)

【以上结果仅供参考,要求不同所用模式也有差别,我这里提供的是一种最基础的方法,希望对大家有所帮助】
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