进入网站 http://swissmodel.expasy.org/
选取Modeling中Automated Mode
在页面上输入你的邮箱(用于接受结果),待分析蛋白质序列(最好是fasta格式)或AC号
也可以直接输入PDB数据库中的ID号
我以序列
>query_prot
DVNMKLTGRIMDAAKEVDHTCRSSTGVPRDMLHRYAEGQTVDDDDFKCYLKCIMVEFNSLSDDGVFVLEEELENVPPEIKEEGHRVVHSCKHINHDEACETAYQIHQCYKQSDPELYSLVVRAFDATIGD
为例,按上述操作得到结果(需要等一段时间,甚至会有好几分钟)为
- (以上为不完全截图,结果页面链接为http://swissmodel.expasy.org/workspace/index.php?func=workspace_modelling&userid=xucongtys@163.com&token=TOKEN&key=11525fa82165c40ee6884048a459d9c9&prjid=P000008)即得到三级预测结果,从结果页面可得到所用模板的PDB ID号,可将结果用pdf格式保存
- (PS:会收到一封邮件,提供结果链接,可保存下来以后直接查看结果)