企业取得不合规增值税专用发票，做进项税转出，增加相关成本，不是补缴企业所得税，而是补交增值税，因为进项税额抵扣减少。
取得不合规定的增值税专用发票，取得时：
借：原材料（或固定资产）
应交税费—应交增值税—进项税额
贷：银行存款（或应付账款）
发现增值税专用发票不符合规定时：
借：原材料（或固定资产）（转出部分）
贷：应交税费—应交增值税—进项税额转出
从以上账务处理来比较，由于进项税额不能抵扣，相应增加相关资产成本（原材料增加生产成本、固定资产增加折旧成本），利润减少，所得税同时也减少。
第二种情况是：企业取得不合规增值税专用发票，不仅不能抵扣进项税额，同时也不能在所得税前扣除，这种情况下，你所采购的原材料不能所得税前扣除，当然就需要补缴企业所得税。
