从中国飞申根国家A，再转机到申根国家B，肯定是在A国入境。
由于入境手续可能持续时间较长，赶不上后续航班倒是有可能的。但是只要你持有效的申根签证，最好再有联程机票，入境不会有任何问题，不管你持哪国签发的申根签证。
BTW:
并非所有加入申根公约的国家均有边境开放，仍有少数成员国要求须另办该国签证始可入境；有部分非成员国开放持申根签证者入境，不必另办该国签证。
自《申根公约》签订以后不断有新的国家加入进来，请每次办理签证前应查询最新适用国家。截至2010年12月31日，「申根区」计有二十五个国家、及八个间接适用申根签证的国家。
