USBKEY和数字证书的区别为：性质不同、安全性不同、验证不同。
一、性质不同
1、USBKEY：USBKEY是一种USB接口的硬件设备，内置了智能芯片，有专用安全区来保存证书私钥。
2、数字证书：数字证书是一种电子文档，是由电子商务认证中心（以下简称为CA中心）所颁发的一种较为权威与公正的证书。
二、安全性不同
1、USBKEY：USBKEY私钥不能导出，因此备份的文件无法使用，其安全性高于数字证书。
2、数字证书：数字证书私钥能够导出，因此可以进行证书文件备份恢复，但其安全性低于USBKEY。
三、验证不同
1、USBKEY：USBKEY由使用者在设备上简单的触摸，即可通过USB端口验证使用。
2、数字证书：数字证书需要在客户端安装软件或浏览器控件上验证使用。
