1、六鳃鲨目：软骨鱼纲的1目。只有六鳃鲨科1科3属约4种。中国有3属3种。结构原始。鳃孔6～7个。眼无瞬膜或瞬褶。
有喷水孔。背鳍1个，无硬棘，后位，具臀鳍；胸鳍的中轴骨伸达鳍的前缘，前鳍软骨无辐状鳍条。脊椎分节不完全，但椎体多少钙化,脊索部分或不缢缩。吻软骨1个。
2、鼠鲨目：鼠鲨目又称鲭鲨目，侧孔总目中最大的一个目。包括现代的大多数种类。鳃孔5对。背鳍2个、无棘、具臀鳍。眼无瞬膜或瞬褶。椎体具辐射状钙化区，4个不钙化区无钙化辐条侵入。
颌舌接型，上颌仅以韧带连于头骨。分布于各大洋热带及温带区，一般生活在开放洋区，但常会进入内陆水域。 食量大，食物包括鱼类、海龟、海鸟、海狮、海船上所弃杂物等。被认为较其他鲨类对人更有危害性。
3、虎鲨目：软骨鱼纲板鳃亚纲的一目。仅有1科1属8种。体粗大而短，头高近方形。吻短钝，眼小，椭圆形，上侧位。
鼻孔具鼻口沟。口平横，上、下唇褶发达。上、下颌牙同型，每颌前、后牙异型，前部牙细尖，3～5齿头；后部牙平扁，臼齿状。喷水孔小，位于眼后下方。
4、真鲨目：软骨鱼纲的1目。背鳍2个，无硬棘。具臀鳍。鳃孔5个。颌舌接型。吻软骨3个。眼有瞬褶或瞬膜。
椎体具辐射状钙化区域，4 个不钙化区域有钙化辐条侵入。肠的螺旋瓣呈螺旋形或画卷形。全世界共有4亚目7科49属200余种。中国有4亚目4科23属约60多种,是中国软骨鱼类中属种最多的1个类群。
5、角鲨目：软骨鱼纲板鳃亚纲的一目。有3科21属87种。背鳍2个，硬棘有或无；臀鳍消失。鳃孔5个，椎体环型或多环型。吻软骨1个。主要分布于世界各温水、冷水海区或深海。
6、锯鲨目：软骨鱼纲板鳃亚纲的1目，本目只有锯鲨科1科2属5种，中国只有1种。
