根据IUPAC命名法及1980年中国化学学会命名原则，按各类化合物分述如下。
1．带支链烷烃
主链 选碳链最长、带支链最多者。
编号 按最低系列规则。从靠侧链最近端编号，如两端号码相同时，则依次比较下一取代基位次，最先遇到最小位次定为最低系统（不管取代基性质如何）。例如，
命名为2，3，5-三甲基己烷，不叫2，4，5-三甲基己烷，因2，3，5与2，4，5对比是最低系列。
取代基次序IUPAC规定依英文名第一字母次序排列。我国规定采用立体化学中“次序规则”：优先基团放在后面，如第一原子相同则比较下一原子。例如，
称2-甲基-3-乙基戊烷，因—CH2CH3＞—CH3，故将—CH3放在前面。
2．单官能团化合物
主链 选含官能团的最长碳链、带侧链最多者，称为某烯（或炔、醇、醛、酮、酸、酯、……）。卤代烃、硝基化合物、醚则以烃为母体，以卤素、硝基、烃氧基为取代基，并标明取代基位置。
编号 从靠近官能团（或上述取代基）端开始，按次序规则优先基团列在后面。例如，
3．多官能团化合物
（1）脂肪族
选含官能团最多（尽量包括重键）的最长碳链为主链。官能团词尾取法习惯上按下列次序，
—OH＞—NH2（=NH）＞C≡C＞C=C
如烯、炔处在相同位次时则给双键以最低编号。例如，
（2）脂环族、芳香族
如侧链简单，选环作母体；如取代基复杂，取碳链作主链。例如：
（3）杂环
从杂原子开始编号，有多种杂原子时，按O、S、N、P顺序编号。例如：
4．顺反异构体
（1）顺反命名法
环状化合物用顺、反表示。相同或相似的原子或基因处于同侧称为顺式，处于异侧称为反式。例如，
（2）Z，E命名法
化合物中含有双键时用Z、E表示。按“次序规则”比较双键原子所连基团大小，较大基团处于同侧称为Z，处于异侧称为E。
次序规则是：
（Ⅰ）原子序数大的优先，如I＞Br＞Cl＞S＞P＞F＞O＞N＞C＞H，未共享电子对：为最小；
（Ⅱ）同位素质量高的优先，如D＞H；
（Ⅲ）二个基团中第一个原子相同时，依次比较第二、第三个原子；
（Ⅳ）重键
分别可看作
（Ⅴ）Z优先于 E，R优先于S。
例如
（E）-苯甲醛肟
5．旋光异构体
（1）D，L构型
主要应用于糖类及有关化合物，以甘油醛为标准，规定右旋构型为D，左旋构型为L。凡分子中离羰基最远的手性碳原子的构型与D-（＋）-甘油醛相同的糖称D型；反之属L型。例如，
氨基酸习惯上也用D、L标记。除甘氨酸无旋光性外，α-氨基酸碳原子的构型都是L型。
其余化合物可以通过化学转变的方法，与标准物质相联系确定。例如：
（2）R，S构型
含一个手性碳原子化合物Cabcd命名时，先将手性碳原子上所连四个原子或基团按“次序规则”由大到小排列（比如a＞b＞c＞d），然后将最小的d放在远离观察者方向，其余三个基团指向观察者，则a→b→c顺时针为R，逆时针为S；如d指向观察者，则顺时针为S，逆时针为R。在实际使用中，最常用的表示式是Fischer投影式，例如：
称为（R）-2-氯丁烷。因为Cl＞C2H5＞CH3＞H，最小基团H在C原子上下（表示向后），处于远离观察者的方向，故命名法规定Cl→C2H5→CH3顺时针为R。又如，
命名为（2R、3R）－（＋）- 酒石酸，因为
C2的H在C原子左右（表示向前），处于指向观察者的方向，故按命名法规定，虽然
逆时针，C2为R。C3与C2亦类似。
有机化合物的命名规则中，有“次序规则”规定“较优”基团的排列顺序：原子序数大的为较优基团，如Cl > S > O > N > C > H。
又有多官能团化合物的命名中各官能团的优先次序，按优先次序由大到小排列，其中有：-COOH > -SO3H > --- > -NH2 > -CH=CH- > -O- > -R > -X – > NO2。
次序规则指的是优先命名取代基的次序
官能团的优先次序指的是怎样选择母体
