根据《国家税务总局关于修订《增值税专用发票使用规定》的通知》(国税发〔2006〕156号)第二十八条规定：
一般纳税人丢失已开具专用发票的发票联和抵扣联，如果丢失前已认证相符的，购买方凭销售方提供的相应专用发票记账联复印件及销售方所在地主管税务机关出具的《丢失增值税专用发票已报税证明单》(附件5)，经购买方主管税务机关审核同意后，可作为增值税进项税额的抵扣凭证;
如果丢失前未认证的，购买方凭销售方提供的相应专用发票记账联复印件到主管税务机关进行认证，认证相符的凭该专用发票记账联复印件及销售方所在地主管税务机关出具的《丢失增值税专用发票已报税证明单》，经购买方主管税务机关审核同意后，可作为增值税进项税额的抵扣凭证。
一般纳税人丢失已开具专用发票的抵扣联，如果丢失前已认证相符的，可使用专用发票发票联复印件留存备查;如果丢失前未认证的，可使用专用发票发票联到主管税务机关认证，专用发票发票联复印件留存备查。
一般纳税人丢失已开具专用发票的发票联，可将专用发票抵扣联作为记账凭证，专用发票抵扣联复印件留存备查。
以上程序均由开票方完成，若责任明确，产生的费用可协商由购货方承担。
扩展资料：
增值税一般纳税人在开具增值税专用发票中经常存在开票有误、发生销货退回以及开具发票退回等情况，需要重新开具增值税专用发票。以下就针对几种情况对重新开具专用发票的政策问题进行整理归纳。
一、收回原发票直接按作废处理，重新开具发票。
这种方式对开票方来说，操作简单，方便快捷。《国家税务总局关于修订增值税专用发票使用规定的通知》（国税发〔2006〕156号）第十三条规定：
一般纳税人在开具专用发票当月，发生销货退回、开票有误等情形，收到退回的发票联、抵扣联符合作废条件的，按作废处理；开具时发现有误的，可即时作废。
作废专用发票须在防伪税控系统中将相应的数据电文按“作废”处理，在纸质专用发票（含未打印的专用发票）各联次上注明“作废”字样，全联次留存。
但是，税务机关对专用发票的作废条件规定相对严格，必须同时符合以下三个条件：收到退回的发票联、抵扣联时间未超过销售方开票当月；销售方未抄税并且未记账；购买方未认证或者认证结果为“纳税人识别号认证不符”、“专用发票代码、号码认证不符”。
二、凭购买方出具的通知单开具红字专用发票后，重新开具发票。
由于专用发票作废条件相对严格，一些纳税人发现开具发票错误后，往往是跨月了或已经抄税等，对于这种不能作废的发票而又需要重新开具发票的，销货方应先开具红字发票冲销原发票，再重新开具正确的专用发票。
国税发〔2006〕156号第十四条规定：一般纳税人取得专用发票后，发生销货退回、开票有误等情形但不符合作废条件的，或者因销货部分退回及发生销售折让的，购买方应向主管税务机关填报《开具红字增值税专用发票申请单》（以下简称申请单）。
主管税务机关出具《开具红字增值税专用发票通知单》（以下简称通知单）的条件是申请单所对应的蓝字专用发票应经税务机关认证，经认证结果或为“认证相符”，或为“纳税人识别号认证不符”、“专用发票代码、号码认证不符”。
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