清单计算工程量与定额计算工程量之间计价依据不同，计价程序不同，计价项目划分不同，工程量计算规则不同，单价组成不同，具体如下：
1、计价依据不同。清单计算工程量是企业定额，市场竞争定价；定额计算工程量：是政府定价，统一的预算定额＋费用定额＋调价系数。
2、计价程序不同。定额计算工程量的思路与程序是：直接费+间接费+利润+差价+规费+税金。清单计算工程量的思路与程序是：分部分项工程费+措施项目费+其它项目费+规费+税金。
3、计价项目划分不同
①定额计价模式中计价项目的划分以施工工序为主，内容单一（有一个工序即有一个计价项目）。而清单计价模式中计价项目的划分分别以工程实体为对象，项目综合度较大，将形成某实体部位或构件必须的多项工序或工程内容并为一体，能直观地反映出该实体的基本价格。
②定额计价模式中计价项目的工程实体与措施合二为一。即该项目既有实体因素又包含措施因素在内。而清单计价模式工程量计算方法是将实体部分与措施部分分离，有利于业主、企业视工程实际自主组价，实现了个别成本控制。
③定额计价模式的项目划分中着重考虑了施工方法因素，从而限制了企业优势的展现，而清单计价模式的项目中不再与施工方法挂钩，而是将施工方法的因素放在组价中由计价人考虑。
4、工程量计算规则不同
定额计价模式按分部分项工程的实际发生量计量，而清单计价模式则按分部分项实物工程量净量计量，当分部分项子目综合多个工程内容时，以主体工程内容的单位为该项目的计量单位。
比如：挖10m底面宽为1.8m，深2m的砖基础土方，定额计价的工程量计算要考虑增及工作面及放坡因素，为：（1.8+2×0.2+2×0.33）×2×10=57.2m3，清单计价中工程量的计算不考虑增加工作面及放坡，为1.8×2×10=36m3。又如清单计价的挖基础土方中包括破桩头的工程内容时，无论破桩头的工程量多大均以挖基础土方的工程量m3为单位计价，破桩头不再单列工程量。
5、单价组成不同
定额计价模式中使用的单价为“工料单价法”，即人+材+机，将管理费、利润等在取费中考虑。清单计价模式中使用的单价为“综合单价法”，单价组成为：人工+材料+机械+管理费+利润+风险。使用“综合单价法”更直观的反映了各计价项目（包括构成工程实体的分部分项工程项目和措施项目、其它项目）的实际价格，但现阶段当不包括“规费和税金”。
