初音岛这几部的剧情基本是独立的，即使单看任何一部也不会有太大影响，看完前面当然会有助于对故事背景的了解初音岛系列TV动画的第一部是D.C.中文名一般翻译为初音岛，然后是它的第二季的D.C.S.S.一般翻译为初音岛第二季，两季各26话，这是第一部作品，主角为朝仓纯一、朝仓音梦、芳乃樱等人，他们是第一代初音岛作品的角色。
之后是第二部作品的，D.C.II和它的第二季的D.C.II.S.S.，一般中文翻译为初音岛2和初音岛2第二季，两季各13话，时间背景是在第一部结束后的53年后，主角是樱内义之、朝仓音姬、朝仓由梦等人，音姬和由梦是姐妹，也是上一部作品的主角朝仓纯一与朝仓音梦的孙女。
从2013年1月开始放送初音岛系列的第三部作品，D.C.III，一般翻译为初音岛3，又是全新的主角，主角为芳乃清隆、森园立夏、芳乃夏露露等人。时间背景是第二部结束后的大约20年后，这部与D.C.II关系不是很密切，只是在游戏中会有一些D.C.II中的角色登场。这部中出现的樱是穿越过来的，樱是芳乃清隆和森园立夏前世的孙女。而现在的芳乃清隆和森园立夏已经算是转世了。
