重庆三峡学院于2004年启动了新校区建设筹备工作，2008年1月正式开工。根据学校总体规划，新校区占地面积1600余亩，校舍总建筑面积71万平方米（含教职工住宅），总投资5.2亿元。[29]重庆三峡学院百安新校区位于重庆市万州五桥百安坝区，与重庆三峡医药高等专科学校、重庆安全职业技术学院相邻，西可望滚滚长江，东邻魏家岩，这些都决定了校园空间结构上与周边环境的互通共融。新校区基地依山环水，可远眺主城区和万州五桥机场，环境优美，植被丰富，其独特的生态环境为新校区的生态化格局定下了良好的基调。
本项目规划用
百安校区规划设计(12张)地总地面积110.43公顷，建筑面积为714600平方米，建成后可容纳在校学生20000人。
在百安新校区总体规划过程中，综合考虑建设目标、功能、用途、基地地形环境、三峡文化内涵以及当地有关部门所提的建设要求和标准等因素，确定以“山林结合”为核心，充分利用原有地形地貌，体现现代化、园林化、地域化、生态化和可持续化原则。
2004年至2006期间，华南理工大学建筑设计研究院承担了百安新校区修建性详细规划设计工作，由中国工程院何镜堂院士担纲主持。2010年至2011年期间，根据重庆市委、市政府及万州区委、区政府的部署要求，结合项目用地实际情况，学校委托机械工业第三设计研究院对百安新校区总体规划进行了优化调整，总体规划布局更加合理和适用。在规划设计前期工作中，还得到了中国科学院彭一刚院士、中国工程院钟训正院士的指导
