所谓微生态主要是用于动物肠道而言，但是目前越来越多的用于植物和水产，应用范围越来越广泛。这些微生物主要指的是益生菌，传统的说法主要是以乳酸菌类为代表的肠道菌群，当然也包括比如酵母菌，比如还有用于饲料之类的枯草芽孢杆菌等，但是实际上用于不同的生物，这个益生菌的指代菌也有变化，同一株菌对于不同的生物有特异性，自身有益它身可能致病，很多益生菌也是条件致病菌。
测定优劣最好的是用于不同动物做生理实验，比如肠道绒毛膜生长观察与定植实验。还有微生物学里的科赫原则实验设计。你问比较笼统，比如用于蛋鸡，可以从产蛋量和蛋壳钙质分析，用于产肉经济动物可以从肉料比分析，禽畜类的料粪、粪便粘稠度、益生菌蛋白酶植酸酶纤维素酶的产酶能力等，用于水产除了肉料比还可以水质净化能力为其中指标，指标也就有了特异性，希望对你有帮助
