日本的大学和专门学校在游戏动画设计专业方面大致有以下几点不同：
大学比较偏重理论，因为学制一般都是4年制（本科），所以肯定是要先从理论一步步学起；而专门学校一般学制2~3年，时间比较浓缩，所以课程多以实际应用为主，毕业之后即便是就能动手操作了。
学习配置方面，大学的专业设置一般多为综合性的，较多元化，动漫设计相关的教学配备不会特别尽善尽美；而专门学校名为专门，在专业设定方面也就较为单一和锁定，比如，有动漫设计专业的专门学校，其学科设立也就以游戏、动漫、设计为主，设备会更加的齐全，师资力量会更加的雄厚。
毕业后得到的文凭也有所不同。大学毕业后自然是本科文凭有学士学位；而专门学校毕业除了学校的毕业证书外，还能相关的专门士资格（等同于我们国内的上岗证），文凭等同于大专。如果学制是4年的专门学校，文凭等同于本科，可以考取日本的大学院（即硕士课程）。
当然，不代表所有的大学都没有专门学校“专业”，在游戏动画设计方面很“专门”也很“专业”的日本大学院校有京都精华大学、多摩美术大学、武藏野美术大学等，但是在日本，就业率高的还属专门学校。
以上仅供参考，祝你早日成功！
