缺勤扣的工资计入旷工或者扣款的科目，不算个税申报；
一、劳动者缺勤，用人单位可以不结算当天缺勤的工资；
二、工资应当以货币的形式支付给劳动者本人。
扩展资料：
收入计算：
（一）工资、薪金所得，以每月收入额减除费用5000元后的余额为应纳税所得额。
（二）个体工商户的生产、经营所得，按照应纳税所得额计算。实行查账征收的，按照每一纳税年度的收入总额减除成本、费用以及损失后的余额计算；实行定期定额征收的，按照纳税人自行申报的年度应纳税所得额计算，或者按照其自行申报的年度应纳税经营额乘以应税所得率计算。
（三）对企事业单位的承包经营、承租经营所得，按照每一纳税年度的收入总额计算，即按照承包经营、承租经营者实际取得的经营利润，加上从承包、承租的企事业单位中取得的工资、薪金性质的所得计算。
（四）劳务报酬所得，稿酬所得，特许权使用费所得，按照未减除费用（每次800元或者每次收入的20%）的收入额计算。
（五）财产租赁所得，按照未减除费用（每次800元或者每次收入的20%）和修缮费用的收入额计算。
参考资料来源：百度百科-个税申报
