亲，你算是碰对人了，我可以来回答你的问题。
首先，得你自己回去核实一下：一般的工厂配置高压侧的电度表为专用的电度表，计量精度高；而低压侧的表多为智能仪表，可以显示电压、电流以及电度的计量，但其精度相对较低。所以会有：
1、低压侧的电量高于高压侧的电量，只能说明高压侧计量准确，而低压侧为正误差，变压器是接在高低压之间的，他得损耗应包括在高压计量内（不在低压计量），而线路损耗则应计量在上一级高压计量内。
2、基本电费是，相对于你厂内电力设备的装机容量或者是根据最大需量来计算的。比如说，按装机容量来定的话，假设厂内有2台31500KVA，当地电力系统收取24元/KVA，则有每月收取的基本电费应为31500*2*24=1512000元。这个跟电量的使用多少是没有任何关系的。
3、低压侧你们应该有装低压无功补偿装置吧，功率因数的事情，只要高压进线处的功率因数值在当地电力系统规定的范围就行。我们这边是规定一般大于等于0.9就可以了。
4、另外，损耗3000/65000=0.046=4.6%而已，不大，算是正常范围内吧。我们工厂也都在+5%以内。至于你们之前的只有300-600，算起来损耗还不及+1%，估计是刚开始，用电量不大，或者说是早期，还无法准确确定。
