经济适用房与商品房的本质区别：
1、土地供应方式不同
商品房按现行法律规定要实行土地出让，交纳土地出让金。经济适用住房不交土地出让金，土地使用权国家划拨。
2、两种建设方式的优惠不同
商品房是一种市场化的运作方式，而经济适用房土地使用权是通过划拨方式取得的，国家在其开发过程中减免了若干税费，所以同地段经济适用房与商品房差异要在500—800元平方米之间。
3、经济适用房与商品房的价格确定方式不同
经济适用房是由政府确定指导价，7项成本加3％的利润率就是经济适用房的价格。商品房价格由市场调节，政府不加干预。
4、设计不同
因为具有经济性与适用性的要求，所以经济适用房的面积要适中，能保证功能齐全即可。而商品房的面积却无明确要求。
5、设备标准要求不同
出于市场竞争的需要，许多商品房都在采用进口设备设施；而经济适用房则要选用价格适中，质量较好的材料，不能追求高档。
6、操作方式不同
经济适用房政府参与较多，政府划拨土地后，确定容积率、配套等基本指标后，实行招标。而商品房政府基本不予干预，由市场调节。
7、销售对象不同
商品房是市场化的，任何人都可能购买；经济适用房明确售给中低收入家庭。经济适用房原则上只允许一个家庭购买一套。
8、两种住房享有权力不同
商品房具有占有、使用、收益、处分等四种完全的所有权权力形式，随时可出售、出租、继承、赠送，交一定税费即可；经济适用房只有占有、使用、处分三权，而收益权受一定限制。出售时要补交上土地出让金。按北京市新近颁布的房改政策规定，收取标定地价的10％，但现在北京尚无标定地价，所以按销售额的3％收取。
在土地收益上，4000元平方米以下的，收益全部归己；4000—5000元平方米的，80％归个人，20％归国家或产权单位；5000元平方米以上的55分成。税收上，也给予一定优惠，契税减半，一年以上，营业税免收。
9、物业管理方式收费标准也要有所区别。商品房政府核定成本构成，由市场进行调节；而经济适用房政府严格规定，国家要求5角平方米以下。
