自然产物本身是无所谓等级的，天然水晶当然也一样，但在人类给了它一个世俗的价格之后，就必然会形成不同的等级。天然水晶不像其他高价位的钻石或宝石，目前这种等级还没有全球统一性的严格区分。但在国内，由于早期一些积极开拓国内市场的业者大家约定俗成，因而通用下列的等级分类——
所谓分类，是指在一般正常亮度的室内，以肉眼观察所见，完全不借助任何放大镜等仪器。如下详述：
（一）白水晶
[AAA级]：全美级，就是整件水晶成品里里外外都透明无暇，也没有任何人工琢磨时造成的伤痕。
[AA级]：比前者低一级，有微细的瑕疵，如天然的内含物，一小片（二、三厘米）云雾状、棉絮状，或者人为的伤痕（用指甲轻刮，无法感觉伤痕），必须注意才会发现。
[A级]：比AA级又低一级，有轻微瑕疵，可能是天然的内含物，云雾状、棉絮状物，也可能是人为撞击的表面伤痕（用指甲轻刮，可以感觉出伤痕），用肉眼很容易看得见。
能评上有含有A等级的白晶都是不错的白晶，因为白晶产量较大，所以容易得到等级品相比较好的白晶。
偶必须在此明确地说明当年所界定的标准；所谓的[AAA级全美]，就是指从里到外干干净净，没有一丁瑕疵；只要其中有一个尘埃般的小点或表面有人为撞击的一个小针点，就不能列入。所以，[AAA级全美]就代表白水晶之中的最高级品，再上去就没有[AAAA级]咯。
（二）紫水晶
[AAA级]：通体透明，完美无暇，通常用来切割琢磨成有刻面的各种宝石，以供吊坠、戒面等珠宝饰物镶嵌之用。大多数个头都不会太大，一般以一克拉至三十多克拉左右居多；当然，高达几百克拉的也有，但数量少，只能做收藏之用。有些颜色浅，但大块的原石也会被用来做装饰品，如神像之类。（我就在香港见到过一尊紫晶观音售价十五万港币）
[AA级]：虽然其中总会有多多少少暇疵，甚至有雾状部分，但如果颜色漂亮，通常会被磨制成吊坠或圆珠手链。
（三）黄水晶
[AAA级]：通体透明，完美无暇，多被切割琢磨成有刻面角度的宝石，以便镶嵌成戒指或吊坠之类的饰品。最近也有三A级全美的黄水晶手链，但价格不菲。
[AA级]：细微的天然暇疵，用来切割成珠串，不规则形状的光滑面的吊坠。
黄水晶的色调从浅黄、明黄、金黄、酒黄到褐黄都有，以明黄、金黄与酒黄色最美，太浅或太深都不讨喜。
（四）茶水晶、墨晶的等级分类和白水晶相同。
（五）粉晶半透明的AAA全美品非常少，都被用来琢磨成各种宝石饰品。而不透明有暇疵者多被用来磨制成晶柱、水晶球或雕刻品。以色调娇艳者为佳。其中以有半透明全美并有星光效应的星光粉晶最稀有，价格最高。
（六）幽灵水晶、异象水晶、骨干水晶（鳄鱼水晶）等无等级之分，以造型美观独特者为佳
