农业生态系统的结构是由人类，当地的自然环境条件（气候，土壤类型等）决定的。
农业生态系统的结构是由农业环境因素、生产者、消费者和分解者四大基本要素构成。
农业环境因素一般包括光能、水分、空气、土壤、营养元素和生物种群，以及人和人的生产活动等。
生产者指自养型生物，主要是绿色植物，包括各种农作物和人工林木等。它们通过光合作用制成有机物质，除供应本身的生长繁育外，还作为其他异养生物的食物和能量来源。生产者又称为初级生产者。
消费者包括草食动物、肉食动物、杂食动物、寄生动物和腐生动物等，均为异养型生物。
分解者主要指依靠动植物残体生存、发育、繁殖的各种微生物
