员工申请劳动仲裁的主要证据包括：
1、来自用人单位的各种证据，比如用人单位和员工签订的劳动合同或者可以证明劳动关系的文件资料，员工的工资单、用人单位签订劳动合同时收取押金等的收条、用人单位解除或终止劳动关系通知书、出勤记录等。
2、来源于其他主体的证据，如职业中介机构的收费单据。
3、来源于有关社会机构的证据，如发生工伤或职业病后的医疗诊断证明或者职业病诊断证明书、职业病诊断鉴定书、向劳动保障行政部门寄出举报材料等的邮局回执。
4、来源于劳动保障部门的证据，如劳动保障部门告知投诉受理结果或查处结果的通知书等。
扩展资料：
根据我国《劳动争议调解仲裁法》规定
第二十八条 申请人申请仲裁应当提交书面仲裁申请，并按照被申请人人数提交副本。仲裁申请书应当载明下列事项：
（一）劳动者的姓名、性别、年龄、职业、工作单位和住所，用人单位的名称、住所和法定代表人或者主要负责人的姓名、职务；
（二）仲裁请求和所根据的事实、理由；
（三）证据和证据来源、证人姓名和住所。书写仲裁申请确有困难的，可以口头申请，由劳动争议仲裁委员会记入笔录，并告知对方当事人。
参考资料来源：百度百科-中华人民共和国劳动争议调解仲裁法
