海洋细菌是原核微生物的一大类群，不含叶绿素和藻蓝素，只能在海洋中生长、繁殖，是数量最大、分布最广的海洋微生物。它们个体直径一般不超过1微米，形状有球状、杆状、螺旋状或分枝丝状，具有坚韧略具弹性的细胞壁，无真核。海洋中有自养和异养、光能和化能、好氧和厌氧、寄生和腐生，以及浮游和附着等类型的细菌。海洋真菌不超过500种，仅有陆地真菌种数的1%。现知的深海真菌只有5种，它们能够生活在水深5315米的海洋深处。
通过显微镜，我们可以看到海洋细菌的特征。它一共分为三种类型：体形近似球形的叫球菌；身体细长的是杆菌；体形弯曲的是螺旋菌。它们都属于单细胞，内部结构与普通的植物细胞相似。如果细菌在适宜固体培养基表面或内部生长繁殖到一定程度，就形成了肉眼可见的小群体，叫菌落。菌落带有不同的颜色，如绿脓杆菌的菌落是绿色的，葡萄球菌的菌落是金黄色的。细菌菌落的形状、大小和颜色等特点，是鉴别菌种的重要依据。
