清洗缸壁
鱼缸用了一段时间都会在玻璃壁上产生污垢甚至苔藓，可以用磁刮器将鱼缸玻璃上的苔藓和圬垢方便地刮干净。磁刮器是分别由两块一对组成，一块是两片刀片和另一半刷片组成、通过磁性相吸的一对，一手将带刀片的一块放入水内贴住缸壁，另一手将带刷的一片在缸外，使两片相互吸牢，然后将外面一片在有绿苔和圬垢的地方来回移动，里面一片就跟着移动，通过移动的刀子将缸壁上的苔藓和污垢清理干净，速度快省力，清理沏底，绝对不会刮毛玻璃。
清洗过滤系统
对于过滤系统的清洗，要先搞清楚过滤系统有几层。第一层是过滤棉，第二层是生化棉，第三层 玻璃环（陶瓷环、生物石等），第四层 活性炭（吸氨石、麦饭石等）。因过滤桶密封性及安装相对复杂，且为了保护硝化细菌系统，不宜经常清洗，因此，选择的过滤材料要价格贵些比较高极的材料。
第一层是属于物理过滤，主要是将水中的固体残渣阻挡住，所以特别容易脏，清洗也是以这一层为主，其他几层通常很少清洗，常洗反而容易失去硝化菌。清洗是利用给鱼缸换水之机，取出滤棉，在抽出的鱼缸水中反复漂洗，也可利用抽水管对滤棉反冲（当然冲力十分有限）洗。清洗时，一是要注意切不可搓洗，也不必要求洗得过分干净，更不可直接用自来水洗，否则附着在滤棉上的硝化细菌会被您彻底消灭，以至失去生物过滤的作用。
一般情况下只需对鱼缸脏了，进行清洗，并无必要考虑经常消毒。如果缸或用具脏了清洗，打扫是必要的，但要切记：清洗时不要用化学清洗剂，或其它化学试剂。因为清洗剂中的碱性物质、表面活性剂及磷酸盐等，都会对鱼类和水草造成危害。而用热水和海绵塑料加上少许食醋来清洗是较好的方法。
还有鱼缸里经常会有油渍与尘埃浮在水面上，可用薄的吸水纸吸去，办法是用竹筷夹着薄纸轻轻地在水面拖动，即能吸去污物。浮在水面的油渍是因脂肪及放食饵所致，要勤加清理，以防止水质变坏。鱼缸的玻璃上常会黏附水苔等污物，因它会影响鱼儿的生长，所以一定要设法清除。清除时，可用特制的长柄夹夹住刀片来刮除不洁黏附物，刮落在箱底的不洁物，可用塑料吸管吸收，为防止缸底的沙也被吸出，吸管口部可安一个适合的网子。
