1、你需要收集证明你和公司劳动关系的证据，如果工资是发到银行卡上的就去发卡行调交易明细，银行盖章，另外工资条，工作服，工作牌都可以，实在不行就找同事做人证。
2、你要弄清楚你签的保密协议到底是什么？是竞业限制协议还是培训服务期协议？如果是竞业限制协议就应该是你离职后公司给你补偿，如果是培训的服务期协议，也不能把培训所花的费用全部由你承担，所以扣你9000多肯定是不合理的！
3、你可以在仲裁的申请书上，要求公司返还你被扣掉的工资，同时为你补交你工作期间的社保。
扣公司肯定是没有理由的，你只需要提供你与公司劳动关系的证据，至于其他的肯定由公司举证了，你所说的保密协议也是由公司举证的，这份协议是否合理合法还有待考证呢。
你只需要申诉公司克扣你工资就行。
