在东北角的沙美镇，紧靠“金门历史民俗博物馆”还有“金门大学海洋边境管理系”，不算是金门的繁华地区，不过听说是为了以后可能建“金厦大桥”才选的地方。金门校区科系的毕业证书跟本岛一样，因为本来就是同样科系的学生到不同校区上课而已，另外福利比本岛的几个校区好：
1、宿舍是用教学会馆（酒店）改的，台北、桃园校区就是普通大学宿舍，当然最好的宿舍是在美国校区。
2、金门县政府每年有发交通劵，可以用来买东西或者抵机票、船票，陆生也可以跟本地居民一样办县民卡，搭公交不用钱。
3、所有学生只会在金门待两年（大一、大二），之后各自回台北、桃园继续大三、大四。
4、教授都是台北往返，听说光机票就贵的吓人，加上各种建设成本和学生补助，所以听说校方在金门不赚钱，纯粹是为了投资地方教育事业。
5、校方对于考上台北、桃园的学生，选择去金门校区读前两年可以免除学费，对于私立大学来说算是很慷慨的做法，而且入籍金门县的年节福利也很好，所以不少台湾学生也会去读（当然也有港澳、马来西亚等地的学生）。
