“211”“985”工程高校、独立学院取消专升本招生计划主要为了普通高等教育专科层次起点本科教育的管理；同时，保证重点本科院校各项办学条件得以改善。但是，专升本的招生政策并没有改变，一直延续至今。
教育部和国家发改委发布的《关于编报2006年普通高等教育分学校分专业招生计划的通知》，通知中表示，“985工程”和“211工程”重点建设的高校、独立学院和民办院校原则上不举办普通专升本教育。通知还表示，2006年开始，专升本的招生计划由10％减为5％，并纳入国家下达的普通本科总规模内。
两部委在通知中说，各地、各部门在安排2006年计划时要从严控制和逐步压缩本科院校的高职（专科）招生规模，以保证本科院校各项办学条件得以改善。
通知指出，从2006年起，各地普通专升本教育的招生规模要严格控制在当年省属高校高职（专科）应届毕业生的5％以内，并纳入国家下达的普通本科总规模内。此外，要严格普通专升本学生的学费标准，各高校不得借专升本的名义进行高收费、乱收费。
专升本举办学校相关规定
1、可进行普通专升本考试的普通高等院校：各大专层次的普通高校，包括公办和民办的本科院校的专科；公办和民办高等职业技术学院（高职）；公办和民办高等专科学校（高专）。
2、可接收普通专升本学生的普通高等院校：办学条件达到国家设置标准的普通本科院校，经省教育厅批准，可按规定的推荐选拔程序和名额招收优秀高职高毕业生进入本科阶段学习。只有国家公办一、二、三本院校均具有普通专升本招生资质。（教育部和国家发展改革委员会表示，从2005年起“985工程”和“211工程”重点建设的高校，原则上不举办普通专升本教育。）
3、普通高等院校的专科学生结束专科阶段的课程学习之后，根据当年教育部和发改委编报的《全国普通高校招生计划》和《全国普通高校分学校分专业招生计划》（招生计划人数控制在各省当年普通全日制专科应届毕业生总人数的5%及以内），各省普通高等院校公布招生人数、各省级行政部门统一组织的考试，选拔优秀全日制普通专科应届毕业生在毕业之前三年级第二学期参加由各省教育考试院组织的统一考试（部分省份为本科校方出卷），按原专业或相关专业升入本科院校（大三）继续进行两年或三年的正规本科教育。
