博士生与导师之间的关系，理想地说，当然是一种学术共同体内部的、亦师亦友的关系。一方面，导师对博士生有指导的义务，需要尽自己所能将学生培养成为学术共同体的合格成员，师生身份是这种关系的内在组成部分；另一方面，博士生已经是成年人，而且也算一脚踏进了学术共同体，所以导师不能仅仅把博士生当成不懂事的、可以任意支使的小孩子，而是要当作可以平等交流的未来同行来相处。
导师和学生之间，也不应该是一种上司对属下、主人对奴仆的关系，导师应当将公务与私事分开，明白对学生的指导是一种职务行为，不能凭借自己的权威，而支使学生为自己的私事跑腿，或者对自己的研究项目做出无偿贡献、拒绝承认博士生的独立功劳。最近一段时间，国内发生了很多起导师利用自己的权势，对博士生或硕士生颐指气使、透支他们的时间精力、乃至践踏他们的人格尊严的事件。
这些都是前现代“师傅/学徒”制度的余孽，与现代学术共同体的职业化取向背道而驰，应该从高校制度和学术圈文化等方面着手，来制止这类事情的发生。至于导师在多大程度上应该关心博士生的私人生活与心理健康，这个就因人而异了。有的导师可能在指导学生的学术研究之外，完全不关心学生其它方面的生活；有的导师则希望对学生有更多的建议和帮助。
有的导师喜欢经常宴请学生，有的导师则更希望减小和学生在学术范围之外的私人接触。只要以前面提到的师生关系平等化、职业化、现代化为前提，这些其余方面的差异，都属于合理范围之内。
