1、清华大学北京协和医学院
2007年5月18日，中国协和医科大学正式更名为"北京协和医学院";鉴于与清华大学紧密合作办学的需要，同时使用"北京协和医学院-清华大学医学部"的名称，接受教育部、卫生部双重领导，其原有的隶属领导关系、资产关系和经费管理体制保持不变。
2、北京大学医学部(原北京医科大学)
北京大学医学部，前身是国立北京医学专门学校，创建于1912年10月26日，是中国政府教育部依靠中国自己的力量开办的第一所专门传授西方医学的国立学校。2000年4月3日，原北京医科大学与北京大学正式合并，组建新的北京大学。2000年5月4日，北京医科大学正式更名为北京大学医学部。
北医集教学、科研、医疗为一体，以本科教育、研究生教育为主，学科覆盖基础医学、临床医学、口腔医学、药学、预防医学、护理学等六大门类，专业齐全，基础医学口腔医学专业实行八年制，临床医学专业分为五年制和八年制两种。北京大学医学部是国家"211工程"和"985工程"首批建设的高等学校，是中国最重要的医学创新研究基地和高级医药卫生人才的培养基地之一。
3、复旦大学上海医学院(原上海医科大学)
复旦大学上海医学院始建于1927年，原为国立中央大学医学院，是中国创办的第一所国立大学医学院。1932年，国立中央大学医学院独立为国立上海医学院，为当时中国唯一的国立医学院。1939年，抗战爆发后，学院内迁至云南昆明;1940年辗转迁至四川重庆。抗战胜利，学院迁回上海，于1952年更名为上海第一医学院。1985年，上海第一医学院定名为上海医科大学。
4、上海交通大学医学院(原上海第二医科大学)
上海交通大学医学院前身是由圣约翰大学医学院、震旦大学医学院、同德医学院于1952年全国高等学校院系调整时合并而成的上海第二医学院;1985年，更名为上海第二医科大学。1997年，学校通过了"211工程"立项。2005年7月18日，上海交通大学与上海第二医科大学合并，成立了由教育部、上海市人民政府重点共建的上海交通大学医学院，进入"985"高校行列。
5、中山大学医学院(原中山医科大学)
中山大学中山医学院位于广东广州，是隶属于中山大学的二级学院，是教育部、卫生部首批共建高校医学院之一。
中山大学中山医学院前身为创办于1866年立的博济医学堂、创办于1908年春的广东光华医学堂以及创办于1909年春的广东公医学堂;1953年、1954年，三校合并，组建华南医学院;1956年，改名为广州医学院;1957年，改名为中山医学院;1985年，改称中山医科大学;2001年10月，原中山大学和中山医科大学合并为新中山大学，并成立了中山大学中山医学院。
