纳税人在网上勾选认证的操作方法如下：
1.登陆当地的增值税发票选择确认平台。
2.登陆个人的证书密码，然后点击登陆。在网页顶部栏选择【确认勾选】。
3.选择未勾选的发票，可以看到账户下还未勾选确认的发票。
4.点击需要勾选的发票，然后确认发票信息后点击确认即可勾选成功。
扩展资料：
发票勾选知识：
1、勾选认证不再限制于纳税信用A级、B级、C级、M级的增值税一般纳税人，而是扩大到所有一般纳税人（包括D级）。
2、一般纳税人发票勾选认证，是指网上认证增值税进项发票，只要当月还未进行纳税申报，则本月取得的进项发票也可进行勾选认证。
3、如果纳税人无法确定是否属于可以勾选方式抵扣的单位，可以在电脑上连接好金税盘或税控盘，登陆增值税发票查询平台，按照流程指引及检测环境（在平台页面右上角）操作后，录入金税盘或税控盘的证书密码进行登录，如果登录成功，则说明可以使用勾选抵扣法。
