虽然是两个概念，但是还是有一定联系的，中科院的分区参考了JCR的分区标准(都是基于索引数据)，不过中科院的分区比JCR的分区更严格一些。
每个学科分类按照期刊的影响因子高低，平均分为4个区：各学科分类中影响因子前25%(含25%)期刊划分为1区；
各学科分类中影响因子位于学科中总刊数的前25-50%(含50%)为2区；各学科分类中影响因子位于学科中总刊数的前50-75%(含75%)为3区；各学科分类中影响因子位于学科中总刊数的后75%为4区；
中国科学院SCI分区法：中国科学院文献情报中心根据每年的JCR数据，将学科分为14个大类和174个小类。每个学科分类按照期刊的影响因子高低，分为4四个区：各学科分类中影响因子前5%(含5%)期刊划分为1区；
各学科分类中影响因子位于学科中总刊数的前5-20%(含20%)为2区；各学科分类中影响因子位于学科中总刊数的前20-50%(含50%)为3区；各学科分类中影响因子位于学科中总刊数的后50%为4区；存在没有进入四个分区的SCI收录期刊。
