清肠水疗，医学界又称之为结肠洗涤、结肠治疗或高级灌肠。顾名思义，就是用水（而不是使用药物或化学制剂）对整个大肠进行内部清洗。清洗的是直肠到盲肠之间（大肠全程）的自然滤透区域，它是结肠的正常功能受到影响时的一种自然处理方式。
大肠水疗法是一种更能彻底清洗结肠的方法，他只用水而不是化学剂或药剂来清洗结肠，因此不会产生依赖性。在洁净、隐私的舒适环境中，专业人员为您完成整个结肠回复清洁过程，同时可能重建结肠肌肉正确的蠕动节奏，使它能独立健康运作。大多数尚未认识大肠水疗的人，第一反是恐惧和抗拒，可能马上联想到当水从肛门灌入大肠，把大肠的粪便冲走时的感觉。
其实，大肠水疗并不是直接用水，在高压下结肠内聚积的废物大力的冲走，这当然会是很痛苦而不可行的。事实上，大肠水疗采用的水压，只不过是每平方吋一磅的水压，这比自己平时用力大便的压力还要低。再者，成年人的结肠长度为五至六呎，直径为2至3吋，这样低的水压，根本不能把结肠里的废物冲走。
在半小时至1小时的洗肠过程中，其实只有2至8公升的水是流入结肠深处，将长期聚积的废物溶化、稀释。大部分的水是用来推动肛门附近的结肠肌肉，刺激结肠肌肉收缩反应，而将稀释的粪便挤出来，过程机制与一般正常大便无异，因为依然是要靠自己结肠蠕动收缩，将废物排出。可见，大肠水疗其实是一种结肠水力运动，帮助结肠回复正常收缩活动，并不是如一般人所想象的将水冲洗结肠。
