存货余额部分应按存货的适用税率计算补交已抵扣的税款，因为存货在当初购进时其进项税金已作了抵扣。减少了当期应交税金，既然现存货已经退出了企业的经营活动，所以要对先期已抵扣的进项税进行调整。
企业依法注销同时取消增值税一般纳税人资格，说明企业将不再存续，此时清算应注意，企业对所有的资产包括存货是如何处理的，如果分配给股东或投资者，则应视同销售。
账面库存在注销时由清算组作处理：对外销售、分配给股东、抵债等，都需要确认销售确认增值税销项税额。增值税一般纳税人注销时，有库存商品，该部分库存商品已抵扣的进项税额，不做转出处理。
扩展资料
存货发出的计价方法：
1、先进先出法
整体来说，能随时计算发出存货及结存存货的成本，便于存货的日常管理。
2、加权平均法
采用加权平均法时，存货明细账上平时只登记每批收入存货的数量、单价和金额以及发出、结存存货的数量。月末时，一次性计算出发出及结存存货的金额，简化了日常核算的工作量。
3、个别计价法
该方法的成本计算准确，符合实际情况，主要适用于容易识别、存货品种数量不多、单位成本较高的存货计价。
4、移动平均法
采用移动加权平均法计算发出及结存存货的成本比较客观，也符合永续盘存制的要求，便于存货的日常管理和控制。
参考资料来源：百度百科-存货
