消毒方法如下：
一、生石灰消毒。一是干池消毒，排干水或留水深5~10厘米，用量为1~3公斤/平方米。消毒时池塘的四周挖几个大小适宜的水塘，让水流入，再把生石灰放入溶化，趁热立即全池泼洒，次日用长柄泥耙在池底推耙一遍，使石灰浆与塘泥充分混合，以提高消毒效果。二是带水消毒。生石灰用量为2~5公斤/平方米，将生石灰溶化后趁热均匀全池遍洒。
二、茶麸消毒。带水进行，有肥水和促进虾、蟹脱壳、生长的作用。用量为100克/立方米。将茶麸先捣碎，再浸泡1~2天，然后连渣带汁全池均匀泼洒。
漂白粉消毒。干池消毒，漂白粉用量为10~30公斤/平方米。带水消毒用量为20~50公斤/立方米，将漂白粉兑水后全池均匀遍洒。
三、巴豆消毒。养殖虾、蟹的水面用巴豆消毒效果较佳。用量为2~8克/立方米。将巴豆捣碎放入桶内，用3%%盐水浸泡，密封桶口，经2~3天连渣带汁全池均匀泼洒。
以上几种药物对敌害生物及病原体都有一定的杀伤能力，可单独使用，也可以1:1的比例合并使用。在消毒后、放养前要先放几尾鱼或虾、蟹试水，证明毒性确定消失后，再进行大量放养。
